RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SRD5A1P18405 259 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LINC00310P59036 64 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNLZQ5SXM8 178 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNS1Q96KK3 526 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C2orf70A6NJV1 201 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 F2Z2F3 143 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PEMTQ9UBM1 199 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR11H1Q8NG94 326 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MXRA5Q9NR99 2828 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLURP1P55000 103 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DEFB136Q30KP8 78 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C18orf65Q6ZTR6 163 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RCHY1Q96PM5 261 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPX1P07203 203 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IQCJQ1A5X6 159 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 K7EQG2 157 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TFPI2P48307 235 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 S100A12P80511 92 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNFNQ9BYD5 112 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 F6UB75 175 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TWIST1Q15672 202 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C16orf95Q9H693 158 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AMTP48728 403 aa13.08□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HILS1P60008 231 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DEFB1P60022 68 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PSMG4Q5JS54 123 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 JMJD8Q96S16 334 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.08□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HSBP1O75506 76 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF688P0C7X2 276 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRR31Q5SQ13 230 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRR9Q5T870 116 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PMCHP20382 165 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NTF3P20783 257 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF575Q86XF7 245 aa13.07□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 J3KRW8 73 aa13.06□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SSTP61278 116 aa13.06□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.06□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.06□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ODF3Q96PU9 254 aa13.06□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC21Q5SSG8 566 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NAGKQ9UJ70 344 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR5AL1P0C617 328 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LEPP41159 167 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CACNG7P62955 275 aa13.05□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NIT1Q86X76 327 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LINC01006Q8NI28 216 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ITPR2Q14571 2701 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A0J9YX75 114 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 Q6ZWC4 215 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AMN1Q8IY45 258 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DUX3Q96PT4 197 aa13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KLLNB2CW77 178 aa13.03□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SNAI2O43623 268 aa13.03□□□□□ -0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LY6G6DO95868 133 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms