RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MZ25 164 aa7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 OR11H12B2RN74 326 aa7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 COX11Q9Y6N1 276 aa7.9□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF726P1Q15940 193 aa7.89□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.89□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 ID1P41134 155 aa7.88□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 LCN15Q6UWW0 184 aa7.88□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 PSMB3P49720 205 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 RHOBP62745 196 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf92Q96LL3 132 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 CST9LQ9H4G1 147 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 ESDP10768 282 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.85□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-205ENST00000450873 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-205ENST00000450873 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 C3orf84H3BNL1 204 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 OR7C2O60412 319 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 PYYP10082 97 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 PDE6HQ13956 83 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 STHQ8IWL8 128 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf173Q96LM9 149 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-205ENST00000450873 KNCNA6PVL3 124 aa7.82□□□□□ -1.16
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