RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GW15 77 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM189A5PLL7 270 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 A8MTW9 85 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 AMBPP02760 352 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 S100A8P05109 93 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 GPX1P07203 203 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF688P0C7X2 276 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 RAB5AP20339 215 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 EDN2P20800 178 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 TFPI2P48307 235 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 WDR73Q6P4I2 378 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf56Q8N813 242 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 F2Z2F3 143 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-DRB4P13762 266 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 CRIP1P50238 77 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 KCNS1Q96KK3 526 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 C8orf49Q96NF6 230 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 KLLNB2CW77 178 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 OR11H12B2RN74 326 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 SH2D1AO60880 128 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 MT-ND6P03923 174 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 CDKN1BP46527 198 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB131AP59861 70 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01559Q495D7 138 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 BORCS7Q96B45 105 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 H3BMM0 161 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 WIPF1O43516 503 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 ORM1P02763 201 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 CD33P20138 364 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 RIGQ13278 110 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 DNLZQ5SXM8 178 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-211ENST00000425989 JMJD1CQ15652 2540 aa7.15□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 HIGD1CA8MV81 97 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 MED14OSP0DP75 135 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 RAB5BP61020 215 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 STHQ8IWL8 128 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 NUP35Q8NFH5 326 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 Q8TAT8 98 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 NEU1Q99519 415 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GUT8 65 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 C7orf71A4D174 169 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 F6UB75 175 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 TDRG1Q3Y452 100 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 CUBNO60494 3623 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 AGRNO00468 2067 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-DQA1P01909 254 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 OR5AL1P0C617 328 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 CACNG7P62955 275 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 AMTNQ6UX39 209 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 IGLC6P0CF74 106 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 HBBP68871 147 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 GTSF1Q8WW33 167 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 CNFNQ9BYD5 112 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-211ENST00000425989 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.11□□□□□ -1.27
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