RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 HMSDA8MTL9 139 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 TAAR5O14804 337 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 MBP02144 154 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 LEPP41159 167 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ERCC8Q13216 396 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ZNF492Q9P255 531 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PPV4 95 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 RANP62826 216 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 TMED6Q8WW62 240 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 RAB24Q969Q5 203 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 VGLL1Q99990 258 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 A0A0J9YY99 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PPQ1 181 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 C7orf71A4D174 169 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 DIRC3C9JPN6 131 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 SMLR1H3BR10 107 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ARPC5O15511 151 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ZNF726P1Q15940 193 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 PRR9Q5T870 116 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 UPK3BQ9BT76 320 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 OTORQ9NRC9 128 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 SNURFLB1AK76 121 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 H3BNG1 76 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ZNF138P52744 262 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 CD300CQ08708 224 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 GAGE12BA1L429 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 GAGE7O76087 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 GAGE12FP0CL80 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 GAGE12GP0CL81 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 GAGE12IP0CL82 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 GCHFRP30047 84 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-2P60368 255 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 BTN1A1Q13410 526 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZNX1 250 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 PGPA6NDG6 321 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 CXorf1O96002 111 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 HOXA5P20719 270 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 CSN1S1P47710 185 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ESRGQ1W209 222 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 Q6AWC8 147 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 Q8TAT8 98 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-204ENST00000403441 A0A0D9SG52 128 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 GGTLC3B5MD39 225 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 GPX1P07203 203 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 C18orf15Q96N68 181 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PRE2 83 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 J3KRW8 73 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 SEC11BP0C7V7 166 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 LINC00315P59091 139 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZQT7 251 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TVP23CQ96ET8 276 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 EPM2AB3EWF7 344 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 EREGO14944 169 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 BCL2L11O43521 198 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 IGLV2-11P01706 119 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TCRAP04437 139 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TDRG1Q3Y452 100 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 884.2 ms