RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 I3L2K1 104 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 K7ENP7 123 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 DSCR9P59020 149 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 F8W1H4 67 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A16P16260 332 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR14LQ5THK1 2151 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ETDBQ3ZM63 59 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM141Q96I45 108 aa12.92□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 K7EIM0 57 aa12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 HLA-DRB4P13762 266 aa12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF415Q09FC8 603 aa12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GTSF1Q8WW33 167 aa12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PMVKQ15126 192 aa12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SHISA9B4DS77 424 aa12.91□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0U1RRA0 63 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 CEND1Q8N111 149 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFA4O00483 81 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 CKS1BP61024 79 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 LY6G5BQ8NDX9 201 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa12.9□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CDKN1BP46527 198 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF503Q96F45 646 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 C20orf78Q9BR46 151 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 HLA-DMBP28068 263 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 LCNL1Q6ZST4 164 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS33Q8NF86 280 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PLA2G5P39877 138 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.89□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A087WX48 190 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MSMPQ1L6U9 139 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SCRT2Q9NQ03 307 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 C2orf82Q6UX34 121 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PCP2Q8IVA1 136 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RITA1Q96K30 269 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RBAKDNA6NC62 111 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CGB3P0DN86 165 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CGB7P0DN87 165 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV2-23P01705 113 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV1-69P01742 117 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa12.88□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NCKAP5O14513 1909 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 C9JAW5 83 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 E7EUB6 86 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PF4P02776 101 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SPINK8P0C7L1 97 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SPXQ9BT56 116 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 BDP1A6H8Y1 2624 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SEM1Q6ZVN7 128 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 C10orf142B7Z368 130 aa12.86□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 LENEPQ9Y5L5 61 aa12.86□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PRX2 142 aa12.86□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RASL10AQ92737 203 aa12.86□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NPC2P61916 151 aa12.86□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.85□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.85□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 K7ERJ3 54 aa12.85□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CRYGCP07315 174 aa12.85□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV2-8P01709 118 aa12.85□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NPBQ8NG41 125 aa12.85□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 K7EMI3 77 aa12.85□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.84□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV1-47P01700 117 aa12.84□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TECTAO75443 2155 aa12.84□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CFHR4Q92496 578 aa12.84□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MSRB2Q9Y3D2 182 aa12.84□□□□□ -0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP210LQ5VU65 1888 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms