RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 A0A087WW49 117 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GXF2 115 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 XKRY2A2RUG3 117 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf118A6NHY6 69 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 A8MWL6 223 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFA7O95182 113 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 P01737 135 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 RIPPLY3P57055 190 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.54□□□□□ -1.68
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C6orf48-208ENST00000395788 GTSF1Q8WW33 167 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 DUX5Q96PT3 197 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 NEU1Q99519 415 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 VGLL1Q99990 258 aa4.54□□□□□ -1.68
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C6orf48-208ENST00000395788 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.54□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.54□□□□□ -1.68
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C6orf48-208ENST00000395788 LY6G6DO95868 133 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 MT-ND6P03923 174 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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C6orf48-208ENST00000395788 PRR27Q6MZM9 219 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 RNF182Q8N6D2 247 aa4.53□□□□□ -1.68
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C6orf48-208ENST00000395788 DCANP1Q8TF63 244 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.53□□□□□ -1.68
C6orf48-208ENST00000395788 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.52□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ACANP16112 2415 aa4.52□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 C2orf70A6NJV1 201 aa4.52□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 IFITM10A6NMD0 228 aa4.52□□□□□ -1.69
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C6orf48-208ENST00000395788 LINC01619G3V211 115 aa4.52□□□□□ -1.69
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C6orf48-208ENST00000395788 LINC00477Q96M19 166 aa4.52□□□□□ -1.69
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C6orf48-208ENST00000395788 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.51□□□□□ -1.69
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C6orf48-208ENST00000395788 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 Q0VG73 95 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 Q8TAT8 98 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ASCL2Q99929 193 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SMR3AQ99954 134 aa4.51□□□□□ -1.69
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