RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa15.83■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 hDV102S1A0JD36 115 aa15.83■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 SOCS3O14543 225 aa15.83■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 B4DSR2 109 aa15.82■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 NCR2O95944 276 aa15.82■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 C16orf92Q96LL3 132 aa15.82■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLV1-40P01703 118 aa15.82■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 CFHR3Q02985 330 aa15.82■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 SPG11Q96JI7 2443 aa15.81■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 CKS2P33552 79 aa15.81■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 FLNCQ14315 2725 aa15.81■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-11P01762 117 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PCP4P48539 62 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXE3Q13461 319 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR9Q5T870 116 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZQT7 251 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 STPG4Q8N801 248 aa15.8■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PF4V1P10720 104 aa15.79■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa15.79■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PRSS57Q6UWY2 283 aa15.79■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.79■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A096LNT2 108 aa15.79■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 GAS8-AS1O95177 125 aa15.79■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 DSCR9P59020 149 aa15.79■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 H0Y8G0 127 aa15.78■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.78■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 LENEPQ9Y5L5 61 aa15.78■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.78■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 GATA3P23771 443 aa15.77■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 TFPI2P48307 235 aa15.77■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF738Q8NE65 137 aa15.77■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PMCHL2Q9BQD1 86 aa15.77■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.77■□□□□ 0.12
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC01546A6NGU7 62 aa15.77■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 PPBPP02775 128 aa15.77■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 TCF21O43680 179 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 G0S2P27469 103 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 SCRT2Q9NQ03 307 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF580Q9UK33 172 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 HBDP02042 147 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A16P16260 332 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 SNAI2O43623 268 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 FXYD7P58549 80 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 MS4A6AQ9H2W1 248 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 ACACBO00763 2458 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP1LC3AQ9H492 121 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0G2JLM5 398 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 HSBP1L1C9JCN9 74 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFRSF6BO95407 300 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 DEFB1P60022 68 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC01356Q8N9X3 169 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00477Q96M19 166 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 OVOL1O14753 267 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV4-59P01825 116 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 PRB1P04280 392 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM19A4Q96LR4 140 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 EVI2AP22794 236 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 LGALS9BQ3B8N2 356 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 TM4SF20Q53R12 229 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 LGALS9CQ6DKI2 356 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 DLEU1O43261 78 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-202ENST00000335475 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 EDN2P20800 178 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMB8P28062 276 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 FBN2P35556 2912 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BVH4 76 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 GAGE1Q13065 139 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 IFI27L1Q96BM0 104 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 CACNG7P62955 275 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 SMPXQ9UHP9 88 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 NRACQ8N912 160 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 USP24Q9UPU5 2620 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-202ENST00000335475 F6UB75 175 aa15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.3 ms