RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599		M0R3E3	92 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	MPDU1	O75352	247 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	PAX4	O43316	350 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	BTN1A1	Q13410	526 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	SIVA1	O15304	175 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV3-53	P01767	116 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	PYY	P10082	97 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB32	Q13637	225 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A096LPF7	62 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	CSN1S1	P47710	185 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	TCL1A	P56279	114 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF415	Q09FC8	603 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	SLA	Q13239	276 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	ICAM4	Q14773	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TARDBP-231	ENST00000639599	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	KLLN	B2CW77	178 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	PLA2G10	O15496	165 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00315	P59091	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	CD300C	Q08708	224 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	C18orf15	Q96N68	181 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	RYR1	P21817	5038 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	SPINK4	O60575	86 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	NXPH4	O95158	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	NMB	P08949	121 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599		Q8N1X5	172 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	OR7C2	O60412	319 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	NDUFB4	O95168	129 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	CRISP2	P16562	243 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	NFE4	Q86UQ8	179 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10J4	P0C629	311 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF138	P52744	262 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP10-2	P60368	255 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	MUC4	Q99102	2169 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599		E5RGE8	158 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	SRI	P30626	198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	C8orf49	Q96NF6	230 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	VGLL1	Q99990	258 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	IFNA5	P01569	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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