RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 PGPA6NDG6 321 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 CSN3P07498 182 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 OR10J4P0C629 311 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 SLAQ13239 276 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 DEFB136Q30KP8 78 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 LEMD1Q68G75 181 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 C11orf52Q96A22 123 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 FMC1Q96HJ9 113 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF479Q96JC4 524 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 SEC11CQ9BY50 192 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 Q9H3A6 140 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 EPDR1Q9UM22 224 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 RFNGQ9Y644 331 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GV50 99 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM218A2RU14 115 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 B4DEV8 164 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 PEX7O00628 323 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 SAP30O75446 220 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 PYYP10082 97 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 TSPOP30536 169 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2G2P60604 165 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2G1P62253 170 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 CCL20P78556 96 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 PSG3Q16557 428 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 LINC00477Q96M19 166 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 ASCL2Q99929 193 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF727A8MUV8 499 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C9JCJ5 164 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 F8W036 122 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 H3BQ15 152 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 IGLV1-51P01701 117 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 AMBPP02760 352 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TCRAP04437 139 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CT45A10P0DMU9 189 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 MALP21145 153 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 AKR1C3P42330 323 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 MORN5Q5VZ52 161 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SSX7Q7RTT5 188 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SVBPQ8N300 66 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF738Q8NE65 137 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF503Q96F45 646 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ODF3Q96PU9 254 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CBY3A6NI87 242 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 GGTLC3B5MD39 225 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 DIRC3C9JPN6 131 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 K7EQG2 157 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R2P9O14990 202 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFB4O95168 129 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SNAPINO95295 136 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SFTA3P0C7M3 94 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CAMPP49913 170 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 GNG4P50150 75 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CD81P60033 236 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 BTF3L4Q96K17 158 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 RARRES2Q99969 163 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 NAT8Q9UHE5 227 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 OR11H12B2RN74 326 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.9 ms