RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSG101-211ENST00000580814 COX6A1P12074 109 aa3.59□□□□□ -1.83
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TSG101-211ENST00000580814 GNRH2O43555 120 aa3.54□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 C12orf73Q69YU5 71 aa3.54□□□□□ -1.84
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TSG101-211ENST00000580814 MUC7Q8TAX7 377 aa3.54□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 C20orf78Q9BR46 151 aa3.54□□□□□ -1.84
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