RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF876PQ49A33 203 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf71Q6IPW1 123 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 EBLN2Q6P2I7 272 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 CLDND2Q8NHS1 167 aa2.28□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
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PTPRM-204ENST00000577468 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.26□□□□□ -2.05
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PTPRM-204ENST00000577468 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LY75O60449 1722 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TRPM6Q9BX84 2022 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 F2Z2F3 143 aa2.25□□□□□ -2.05
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