RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PAXX	Q9BUH6	204 aa		15.29	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG5	Q9Y673	324 aa		15.29	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10J4	P0C629	311 aa		15.28	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		15.28	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF141	Q8WVD5	230 aa		15.28	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		15.28	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		15.28	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC1	Q9HC57	220 aa		15.28	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf71	A4D174	169 aa		15.27	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200		F5H768	121 aa		15.27	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CRISP2	P16562	243 aa		15.27	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		15.27	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		15.27	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		15.27	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	HERC2	O95714	4834 aa		15.27	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CD300C	Q08708	224 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZR54	194 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	VGLL1	Q99990	258 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R2N4	97 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PTTG1	O95997	202 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA5	P01569	189 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		15.26	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	OR7C2	O60412	319 aa		15.25	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	NMB	P08949	121 aa		15.25	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	BTN1A1	Q13410	526 aa		15.25	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		15.25	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		15.25	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF492	Q9P255	531 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SNURFL	B1AK76	121 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	RTL8C	O15255	209 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR9	Q5T870	116 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE12B	A1L429	117 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE7	O76087	117 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GPX1	P07203	203 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE12F	P0CL80	117 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE12G	P0CL81	117 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE12I	P0CL82	117 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	KHDC3L	Q587J8	217 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200		Q9H3A6	140 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GVY2	172 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	RBAKDN	A6NC62	111 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXA5	P20719	270 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF138	P52744	262 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R45	P59539	299 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZQT7	251 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZTI0	123 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT3	O95989	172 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8TAT8	98 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	C18orf15	Q96N68	181 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC4	Q99102	2169 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PFDN1	O60925	122 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	M6PR	P20645	277 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MED28	Q9H204	178 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CSN1S1	P47710	185 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB2A	P61019	212 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5I1	Q13606	314 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP10	Q96PS8	301 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG101	Q9BSB4	218 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DIRC3	C9JPN6	131 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		Q5BKY6	102 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TCL1A	P56279	114 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF266	Q14584	549 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OTOR	Q9NRC9	128 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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