RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	HLA-DMB	P28068	263 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	DEFB136	Q30KP8	78 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	RNF182	Q8N6D2	247 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	RAX2	Q96IS3	184 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM210B	Q96KR6	192 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SGK494	Q96LW2	274 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541		A8MWL6	223 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	PRAC2	D3DTV9	90 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541		K7EQG2	157 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541		P01737	135 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	CSN3	P07498	182 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	CXCL1	P09341	107 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF138	P52744	262 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	COX19	Q49B96	90 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SMUG1	Q53HV7	270 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	TSKU	Q8WUA8	353 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	VGLL1	Q99990	258 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF738	Q8NE65	137 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	C20orf173	Q96LM9	149 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	ASCL2	Q99929	193 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A1W2PPQ1	181 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	XKRY2	A2RUG3	117 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	EDN2	P20800	178 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	CRIP1	P50238	77 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	PRR27	Q6MZM9	219 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TARBP2-208	ENST00000547541	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	RAB5B	P61020	215 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ERCC8	Q13216	396 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	C8orf49	Q96NF6	230 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	DUX3	Q96PT4	197 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ODF3	Q96PU9	254 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A1W2PRX2	142 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	CRISP2	P16562	243 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541		Q6AWC8	147 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	DNHD1	Q96M86	4753 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	JMJD1C	Q15652	2540 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	OR4C46	A6NHA9	309 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	SH2D1A	O60880	128 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	KRTAP10-3	P60369	221 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	WDR73	Q6P4I2	378 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541		Q8TAT8	98 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A0J9YX75	114 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM189	A5PLL7	270 aa		7.55	□□□□□ -1.2

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