RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRAV41A0A0B4J266 112 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PS18 150 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 PPP5D1E7EU14 171 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 BRI3O95415 125 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TGFAP01135 160 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGLV2-11P01706 119 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGHG2P01859 326 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TCRAP04437 139 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 S100A6P06703 90 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ATP5G2Q06055 141 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 C15orf32Q32M92 178 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GPR82Q96P67 336 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 J3QLI3 93 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LTAP01374 205 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGHG4P01861 327 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GPR183P32249 361 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 AKR1D1P51857 326 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 FMC1Q96HJ9 113 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ATP6V0BQ99437 205 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ATG101Q9BSB4 218 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RNF24Q9Y225 148 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 FAM223BA6NKX1 122 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 H3BUA1 57 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 M0R3E3 92 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IER3P46695 156 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CRIP1P50238 77 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 UBE2G1P62253 170 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 PDE6HQ13956 83 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RPEL1Q2QD12 228 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 S100A7AQ86SG5 101 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SMIM12Q96EX1 92 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 BTF3L4Q96K17 158 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ZNF492Q9P255 531 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RABAC1Q9UI14 185 aa4.11□□□□□ -1.75
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TRDN-205ENST00000546248 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.1□□□□□ -1.75
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TRDN-205ENST00000546248 A0A087X0K7 114 aa4.1□□□□□ -1.75
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF253O75346 499 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SCGB2A1O75556 95 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRBV12-3P01733 135 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGHV4-59P01825 116 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRGV3P03979 118 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
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