RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 M0R2N4 97 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFNA5P01569 189 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRISP2P16562 243 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ICAM4Q14773 271 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q6ZR54 194 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF141Q8WVD5 230 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FXYD5Q96DB9 178 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR10J4P0C629 311 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATG101Q9BSB4 218 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBD2Q9UBB5 411 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTL8CO15255 209 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDT3O95989 172 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPX1P07203 203 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAS2R45P59539 299 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD300CQ08708 224 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF492Q9P255 531 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAGE12BA1L429 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBAKDNA6NC62 111 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR7C2O60412 319 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAGE7O76087 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAGE12FP0CL80 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAGE12GP0CL81 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAGE12IP0CL82 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSN1S1P47710 185 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCL18P55774 89 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF503Q96F45 646 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VGLL1Q99990 258 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAH2Q9P225 4427 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NACAE9PAV3 2078 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BNG1 76 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 M6PRP20645 277 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF138P52744 262 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RANP62826 216 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTN1A1Q13410 526 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5I1Q13606 314 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KHDC3LQ587J8 217 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C18orf15Q96N68 181 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GVY2 172 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTTG1O95997 202 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q9H3A6 140 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WFDC1Q9HC57 220 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALG5Q9Y673 324 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q6ZTI0 123 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGS13O14921 159 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXA5P20719 270 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PPV4 95 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIRC3C9JPN6 131 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPINK4O60575 86 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCL1AP56279 114 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR9Q5T870 116 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMED6Q8WW62 240 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MED28Q9H204 178 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF266Q14584 549 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OTORQ9NRC9 128 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0J9YY99 117 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGPA6NDG6 321 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms