RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 VGLL1Q99990 258 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 Q9H3A6 140 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CSN1S1P47710 185 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 SERF2P84101 59 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 C16orf74Q96GX8 76 aa6.51□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 PGPA6NDG6 321 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 LYRM9A8MSI8 78 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 KLLNB2CW77 178 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 SMLR1H3BR10 107 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ARPC5O15511 151 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 MBP02144 154 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 STAG3L2P0CL84 134 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 STAG3L3P0CL85 134 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 HTN3P15516 51 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 DAD1P61803 113 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CD300CQ08708 224 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RAB24Q969Q5 203 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 HYLS1Q96M11 299 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ZNF492Q9P255 531 aa6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 C7orf71A4D174 169 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RBAKDNA6NC62 111 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 DIRC3C9JPN6 131 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 TAAR5O14804 337 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 GPX1P07203 203 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 NMBP08949 121 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 DEFB130BP0DP73 79 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 DEFB130AP0DP74 79 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CRISP2P16562 243 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ZNF138P52744 262 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 BTN1A1Q13410 526 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 OTORQ9NRC9 128 aa6.49□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.48□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 PRR9Q5T870 116 aa6.48□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.48□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 Q8TAT8 98 aa6.48□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.48□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 FAM210BQ96KR6 192 aa6.48□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.48□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CBY3A6NI87 242 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 CXorf1O96002 111 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 GCHFRP30047 84 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZQT7 251 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 SUN5Q8TC36 379 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.47□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 HMSDA8MTL9 139 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 SNURFLB1AK76 121 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 F5H768 121 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ATP5G1P05496 136 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ATP5G3P48201 142 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GNG5P63218 68 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ZNF726P1Q15940 193 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 SSX7Q7RTT5 188 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMED6Q8WW62 240 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.46□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.46□□□□□ -1.38
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