RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		G3V3Q6	166 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BUA1	57 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		K7EPK0	472 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	VCY	O14598	125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NXPH3	O95157	252 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ELANE	P08246	267 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A6	P12236	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10J1	P30954	320 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNCA	P37840	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFA6	P56556	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNG5	P63218	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OPCML	Q14982	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	MED28	Q9H204	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	HBE1	P02100	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRGV3	P03979	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	REG1A	P05451	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		P0C879	139 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FABP4	P15090	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TPPP2	P59282	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBKS	Q9H477	322 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0D9SG52	128 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		C9JAW5	83 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		E7EUB6	86 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD28	P10747	220 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	NTF3	P20783	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TFPI2	P48307	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	CFHR3	Q02985	330 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAST4	O15021	2626 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		H7BYZ3	331 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SYNGR2	O43760	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PITX3	O75364	302 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRH1	P02810	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IAPP	P10997	89 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMB8	P28062	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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