RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 MBP02144 154 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 CSN1S1P47710 185 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 TCTAP57738 103 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 VGLL1Q99990 258 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM19A4Q96LR4 140 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 APLNQ9ULZ1 77 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 ARPC5O15511 151 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM78Q5T7P6 136 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 PGPA6NDG6 321 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB24Q969Q5 203 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 HYLS1Q96M11 299 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP4-204ENST00000416021 ALMS1Q8TCU4 4167 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 HYDINQ4G0P3 5121 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 LYRM9A8MSI8 78 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 TAAR5O14804 337 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 STAG3L2P0CL84 134 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 STAG3L3P0CL85 134 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 DAD1P61803 113 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 LGALS9CQ6DKI2 356 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF493Q6ZR52 646 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC28AQ8IWP9 274 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf74Q96GX8 76 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 OTORQ9NRC9 128 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF492Q9P255 531 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 KLLNB2CW77 178 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 GPX1P07203 203 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 NMBP08949 121 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CRISP2P16562 243 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF138P52744 262 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CD300CQ08708 224 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf71A4D174 169 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 RBAKDNA6NC62 111 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 DIRC3C9JPN6 131 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB130BP0DP73 79 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB130AP0DP74 79 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 BTN1A1Q13410 526 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 HTN3P15516 51 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 GCHFRP30047 84 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8TAT8 98 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 SUN5Q8TC36 379 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 HMSDA8MTL9 139 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CXorf1O96002 111 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR9Q5T870 116 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX7Q7RTT5 188 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM210BQ96KR6 192 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CBY3A6NI87 242 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF345Q14585 488 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF726P1Q15940 193 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZQT7 251 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0D9SG52 128 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 SNURFLB1AK76 121 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 TMED6Q8WW62 240 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 GNG5P63218 68 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS13O14921 159 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 F5H768 121 aa14.89□□□□□ -0.03
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