RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 JPT2Q9H910 190 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 PLCE1Q9P212 2302 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 LMO1P25800 156 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 LINC00477Q96M19 166 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 FOXI1Q12951 378 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 KLRD1Q13241 179 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 PRR25Q96S07 402 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 NDUFB8O95169 186 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 LTAP01374 205 aa7.85□□□□□ -1.15
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HERC3-202ENST00000402738 CFC1P0CG37 223 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 TMEM141Q96I45 108 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 DOCK7Q96N67 2140 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 J3QQQ9 107 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 TEN1Q86WV5 123 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 RNF183Q96D59 192 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 HERV-K104P63124 156 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.84□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 WT1-ASQ06250 92 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 IGHG4P01861 327 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 WDR86Q86TI4 376 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 CREBBPQ92793 2442 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 SYNJ2BPP57105 145 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 IGLV3-1P01715 115 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 RNF5Q99942 180 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.82□□□□□ -1.16
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HERC3-202ENST00000402738 TMEM178BH3BS89 294 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ZNF134P52741 427 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 HAMPP81172 84 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C20orf78Q9BR46 151 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 J3KT08 172 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 PTH2Q96A98 100 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 DKK1O94907 266 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 LYPD6Q86Y78 171 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C17orf77Q96MU5 243 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 UBL5Q9BZL1 73 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 CACNA1HO95180 2353 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 Q0VFX4 171 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TMEM219Q86XT9 240 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 DPH3Q96FX2 82 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-53P01767 116 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ATP5J2P56134 94 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 CR1LQ2VPA4 569 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C2orf70A6NJV1 201 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 H3BRN7 92 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C15orf65H3BRN8 121 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZR03 302 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 STHQ8IWL8 128 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 KNCNA6PVL3 124 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G5P39877 138 aa7.79□□□□□ -1.16
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