RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF575Q86XF7 245 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 HBDP02042 147 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 COX8AP10176 69 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 CNFNQ9BYD5 112 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 LMO4P61968 165 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 CLEC19AQ6UXS0 136 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 DPF1Q92782 380 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC140Q96MF4 163 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 PRAC2D3DTV9 90 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NPYP01303 97 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PCP4P48539 62 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LGALS9BQ3B8N2 356 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LGALS9CQ6DKI2 356 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NBASA2RRP1 2371 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 CLPSL1A2RUU4 121 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PAX8Q06710 450 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01559Q495D7 138 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NPFFO15130 113 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 G3V318 75 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 SMKR1H3BMG3 65 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PPBPP02775 128 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RNF182Q8N6D2 247 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 BPESC1Q9GZL8 116 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IGF2RP11717 2491 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RNF185Q96GF1 192 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01548A6NM66 108 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RBX1P62877 108 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 METTL26Q96S19 204 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IL17RELQ6ZVW7 336 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 OR1N2Q8NGR9 330 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 MSRB1Q9NZV6 116 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RELNP78509 3460 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NHLH1Q02575 133 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PIP4P2Q8N4L2 257 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB125Q8N687 156 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 C5orf56Q8N8D9 126 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 MAP1LC3AQ9H492 121 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IFI27L1Q96BM0 104 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TAX1BP3O14907 124 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 CACNG7P62955 275 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 FXYD7P58549 80 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS57Q6UWY2 283 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf91Q6ZV80 131 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 OR4C5Q8NGB2 326 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ATRXP46100 2492 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01546A6NGU7 62 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ATP5G2Q06055 141 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 HIF1ANQ9NWT6 349 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 CDKN1BP46527 198 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM78Q5T7P6 136 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ATP6V0BQ99437 205 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 U3KQE9 123 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD39Q53RE8 183 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 MED13LQ71F56 2210 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 VAMP3Q15836 100 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 CD5LO43866 347 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf86Q6ZUL3 223 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 MOB4Q9Y3A3 225 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 FGF6P10767 208 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TNFRSF6BO95407 300 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 LY6DQ14210 128 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 PPIFP30405 207 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 CSMD1Q96PZ7 3565 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV41A0A0B4J266 112 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 FAM223BA6NKX1 122 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 FAM223AQ8IWN6 122 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf21Q9P2W6 132 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 SNAI2O43623 268 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM219Q86XT9 240 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 FCER1GP30273 86 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C19orf54Q5BKX5 351 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 BOD1L2Q8IYS8 172 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM97Q5BJF2 176 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 GAS8-AS1O95177 125 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms