RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384671.1

RNU6-959P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 959, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-959P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-959P-201ENST00000384671 H0Y980 276 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 GCHFRP30047 84 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 PHBP35232 272 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 C22orf39Q6P5X5 142 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 COMMD7Q86VX2 200 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR4K15Q8NH41 348 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM172AQ8WUF8 416 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 CST11Q9H112 138 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 NCOA1Q15788 1441 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 BCE1O60756 84 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 COX6B1P14854 86 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 RAB5BP61020 215 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 MYL5Q02045 173 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 LRRN1Q6UXK5 716 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 TCRBP04435 133 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 C20orf27Q9GZN8 174 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM242Q9NWH2 141 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 G3V318 75 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 I3L2K1 104 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 UCHL3P15374 230 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 DEFA1P59665 94 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 COA4Q9NYJ1 87 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 NUP155O75694 1391 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLAMF1Q13291 335 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 STAG3L4Q8TBR4 150 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 SDF2Q99470 211 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 WNK3Q9BYP7 1800 aa-3.91□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 GOLGA3Q08378 1498 aa-3.91□□□□□ -3.03
RNU6-959P-201ENST00000384671 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM159BA6NKW6 160 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 EVPLLA8MZ36 301 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 PYYP10082 97 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 GLRXP35754 106 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 RANP62826 216 aaKnown RBP-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 AESQ08117 197 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 C1orf195Q5TG92 126 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 SPOPLQ6IQ16 392 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 C1orf109Q9NX04 203 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ORM1P02763 201 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 AP3S2P59780 193 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 TNNC1P63316 161 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 PMAIP1Q13794 54 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 YPEL2Q96QA6 119 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ADAMTS12P58397 1594 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 CRYZL1O95825 349 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 RBP1P09455 135 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 SYT1P21579 422 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 CD302Q8IX05 232 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRT222Q8N1A0 295 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 LINC00269Q8N2A0 174 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 PIGXQ8TBF5 258 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 BIRC5O15392 142 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 BRI3O95415 125 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 MT1GP13640 62 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 CST9Q5W186 159 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM141Q96I45 108 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 C2orf50Q96LR7 162 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 PAPPAQ13219 1627 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ATMQ13315 3056 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 M0R036 132 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 AKR1D1P51857 326 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 NAA20P61599 178 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 INSL4Q14641 139 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 SMIM19Q96E16 107 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR4C12Q96R67 309 aa-3.95□□□□□ -3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms