RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SH2D1AO60880 128 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 P0DMU3 169 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FAM231AP0DMU4 169 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FAM231CP0DMU5 169 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 MUC21Q5SSG8 566 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 STHQ8IWL8 128 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 MPV17L2Q567V2 206 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 RNF183Q96D59 192 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.97□□□□□ -1.77
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PTPRD-201ENST00000355233 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087X0K7 114 aa3.97□□□□□ -1.77
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PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1-5P01602 117 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CD7P09564 240 aa3.97□□□□□ -1.77
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PTPRD-201ENST00000355233 MDS2Q8NDY4 140 aa3.96□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CACNA1GO43497 2377 aa3.96□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 B4DSR2 109 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-7P01780 117 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 H7C2G1 150 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 TGFAP01135 160 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 RNF114Q9Y508 228 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PRM7 423 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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PTPRD-201ENST00000355233 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 APOC4P55056 127 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 PRR20EP86478 221 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 PRR20CP86479 221 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 PRR20DP86480 221 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 PRR20BP86481 221 aa3.94□□□□□ -1.78
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