RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPWQ5EE01 88 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM110AQ9BQ89 295 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANK2Q01484 3957 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0J9YX75 114 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD7P09564 240 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM241Q24JQ0 296 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTL10Q5JWF8 245 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAGE2Q86Y30 109 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 APRG1Q8IVJ8 170 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDFIP1Q9BT67 221 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPB6E9PJ23 425 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV2-11P01706 119 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF138P52744 262 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q86TA4 180 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 KNCNA6PVL3 124 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9JCJ5 164 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADCYAP1P18509 176 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAT8Q9UHE5 227 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP30Q9Y2G7 519 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOTCH3Q9UM47 2321 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF5OSQ5U4N7 250 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4B1Q8NGF8 309 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q8TAT8 98 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6V1G1O75348 118 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 LTAP01374 205 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DRB4P13762 266 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF124Q15973 351 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF492Q9P255 531 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 STHQ8IWL8 128 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV3-20P01619 116 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf91Q5T1B1 145 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 TVP23CQ96ET8 276 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM12Q96EX1 92 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR25Q96S07 402 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY96Q9Y6Y9 160 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BMM0 161 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOC3P02656 99 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGST1P10620 155 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NHLRC2Q8NBF2 726 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASCL2Q99929 193 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 LENEPQ9Y5L5 61 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGPEP1LA6NFU8 196 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT45A10P0DMU9 189 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM183AQ8IXX5 376 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 OCC1Q8TAD7 63 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDF2L1Q9HCN8 221 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf73Q9NVV2 129 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SORL1Q92673 2214 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADIRFQ15847 76 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 G3V4G9 280 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 S100A1P23297 94 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 BIN3Q9NQY0 253 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R036 132 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ODF3Q96PU9 254 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFDC10AQ9H1F0 79 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPOP30536 169 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LEPP41159 167 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL23P62829 140 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMUG1Q53HV7 270 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01551Q86U37 167 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf49Q96NF6 230 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAMD5Q5TGI4 173 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SVBPQ8N300 66 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB125Q8N687 156 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLST8Q9BVC4 326 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV2-8P01709 118 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR27Q6MZM9 219 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLUHP3Q96NS8 147 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 J3KRW8 73 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPX1P07203 203 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRTAP10-11P60412 298 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 A8MTW9 85 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 K7EN84 100 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM19A4Q96LR4 140 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNAPINO95295 136 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCGP01275 180 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRISP2P16562 243 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5I1Q13606 314 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRD5A3Q9H8P0 318 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDKN1BP46527 198 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMTNQ6UX39 209 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 COX8CQ7Z4L0 72 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q8N1Y9 231 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.6 ms