RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602698.5

HCG18-247, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-247ENST00000602698 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 Q6ZRG5 221 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C2orf50Q96LR7 162 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 CCDC32Q9BV29 185 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 HSPG2P98160 4391 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 IGSF23A1L1A6 192 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 CBY3A6NI87 242 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 H3BQ15 152 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 SULT1A1P50225 295 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 S100A10P60903 97 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 GUK1Q16774 197 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 PFDN5Q99471 154 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 ATG101Q9BSB4 218 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 ZNF253O75346 499 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 NUDT3O95989 172 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 MED14OSP0DP75 135 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 S100A11P31949 105 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 BAXQ07812 192 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 IL15RAQ13261 267 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 RAB32Q13637 225 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 STX12Q86Y82 276 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.7□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 ODF3Q96PU9 254 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.69□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 J3KRW8 73 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 CT45A10P0DMU9 189 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 FGF7P21781 194 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 LEPP41159 167 aa6.69□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 HBG2P69892 147 aa6.69□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.68□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.68□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.67□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.66□□□□□ -1.34
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HCG18-247ENST00000602698 GAGE7O76087 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 GAGE12FP0CL80 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 GAGE12GP0CL81 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 GAGE12IP0CL82 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 M6PRP20645 277 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 HOXA5P20719 270 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 ERCC8Q13216 396 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-247ENST00000602698 OR5I1Q13606 314 aa6.66□□□□□ -1.34
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