RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502686.6

CTCFL-211, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,023 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-211ENST00000502686 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.9□□□□□ -0.82
CTCFL-211ENST00000502686 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.9□□□□□ -0.82
CTCFL-211ENST00000502686 NRN1Q9NPD7 142 aa9.9□□□□□ -0.82
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTCFL-211ENST00000502686 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 F6UZH7 168 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 RAB5AP20339 215 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 HLA-DMBP28068 263 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 GNG5P63218 68 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 ZFP82Q8N141 532 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 RNF182Q8N6D2 247 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 C16orf92Q96LL3 132 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 YPEL4Q96NS1 127 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 NAT8Q9UHE5 227 aa9.89□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 CXorf65A6NEN9 183 aa9.88□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 M0R3E3 92 aa9.88□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 SOCS3O14543 225 aa9.88□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 SAP30O75446 220 aa9.88□□□□□ -0.83
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CTCFL-211ENST00000502686 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.88□□□□□ -0.83
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CTCFL-211ENST00000502686 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.88□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 PARLQ9H300 379 aa9.88□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 EPDR1Q9UM22 224 aa9.88□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.87□□□□□ -0.83
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CTCFL-211ENST00000502686 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 C11orf52Q96A22 123 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 PEX7O00628 323 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 DCANP1Q8TF63 244 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 DERL1Q9BUN8 251 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.87□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 TCRAP04437 139 aa9.86□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 ELOBQ15370 118 aa9.86□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 ADIRFQ15847 76 aa9.86□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 C20orf173Q96LM9 149 aa9.86□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.86□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 LINC00479Q96M42 142 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 ATG101Q9BSB4 218 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 BIN3Q9NQY0 253 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 DIRC3C9JPN6 131 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 K7EQG2 157 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 ISLRO14498 428 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 CSN1S1P47710 185 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 PSG3Q16557 428 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 LCN12Q6JVE5 192 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 PRELID1Q9Y255 219 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 PAFAH1B2P68402 229 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-211ENST00000502686 PRAC2D3DTV9 90 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 CXCL1P09341 107 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 ID1P41134 155 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 SGK494Q96LW2 274 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 IGLV1-51P01701 117 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF688P0C7X2 276 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF738Q8NE65 137 aa9.83□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 CD33P20138 364 aa9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 DEFB1P60022 68 aa9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 MDFIQ99750 246 aa9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 PSMG4Q5JS54 123 aa9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.81□□□□□ -0.84
CTCFL-211ENST00000502686 K7EQM0 130 aa9.81□□□□□ -0.84
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