RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PSG8Q9UQ74 426 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SPINK4O60575 86 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 P01737 135 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 FABP4P15090 132 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35B1P78383 322 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NEU1Q99519 415 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF580Q9UK33 172 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 HIGD1CA8MV81 97 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 A8MWL6 223 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 FSHBP01225 129 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 HLA-DQA1P01909 254 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CSN1S1P47710 185 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TPPP2P59282 170 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZS46 218 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 USMG5Q96IX5 58 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 U3KQE9 123 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 FAM231BA6NCW3 169 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV1-40P01703 118 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 AMBPP02760 352 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PYY3Q5JQD4 70 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SVIPQ8NHG7 77 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 METTL26Q96S19 204 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SMR3AQ99954 134 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF785A8K8V0 405 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4-59P01825 116 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHG4P01861 327 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ARL3P36405 182 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CFHR3Q02985 330 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CRISP2P16562 243 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 GTSF1Q8WW33 167 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NIT2Q9NQR4 276 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GXF2 115 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CHEK1O14757 476 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 RAB4BP61018 213 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 Q0VG73 95 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 OR5R1Q8NH85 324 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0G2JLM5 398 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GUS0 222 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA4O00483 81 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV12-3P01733 135 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PF4V1P10720 104 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TCF24Q7RTU0 167 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM18Q96B42 140 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 KLK15Q9H2R5 256 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 LY6G6DO95868 133 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ESDP10768 282 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 HLA-DMBP28068 263 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CRIP1P50238 77 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 LCN12Q6JVE5 192 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf49Q96NF6 230 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ASCL2Q99929 193 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CD5LO43866 347 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NUPR1O60356 82 aa6.28□□□□□ -1.4
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