RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-DRB4P13762 266 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 FUT5Q11128 374 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 OR52N5Q8NH56 324 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 C18orf15Q96N68 181 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 C8orf87E5RJ46 101 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 F6UB75 175 aa6.86□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 PTGDSP41222 190 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 DAPP51397 102 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 SLURP1P55000 103 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2G1P62253 170 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 OR5AS1Q8N127 324 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.86□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 CD55P08174 381 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 MYCNOSP40205 109 aa6.84□□□□□ -1.31
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RABGGTB-214ENST00000497648 PGPA6NDG6 321 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNGR2O43760 224 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R3DO95685 299 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 PRH1P02810 166 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-214ENST00000497648 CEND1Q8N111 149 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01600Q96MT4 127 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 C16orf95Q9H693 158 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-214ENST00000497648 CSRP3P50461 194 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-214ENST00000497648 CFHR3Q02985 330 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ICAM4Q14773 271 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 WDR86Q86TI4 376 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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