RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	DOK5	Q9P104	306 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PRE2	83 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CLDN34	H7C241	214 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	REG1A	P05451	166 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	HNF1A	P20823	631 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CEBPG	P53567	150 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TAS2R45	P59539	299 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	UBE2G2	P60604	165 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	LCN2	P80188	198 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	MMD	Q15546	238 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	PATE2	Q6UY27	113 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		Q8WTZ3	238 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ACY3	Q96HD9	319 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	PFDN5	Q99471	154 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CCL19	Q99731	98 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		C9JCJ5	164 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		K7EIM0	57 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	HLA-DRB1	P01911	266 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CXCL1	P09341	107 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	IGLC1	P0CG04	106 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CD99	P14209	185 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	RAB5A	P20339	215 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	RAB5B	P61020	215 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF90	Q03938	601 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	FXYD3	Q14802	87 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	PLGLA	Q15195	96 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TIGIT	Q495A1	244 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		Q8N9W7	124 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ACACB	O00763	2458 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PRD5	423 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PRF3	423 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PRM7	423 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	PPP1R2P9	O14990	202 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	NPFF	O15130	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TGOLN2	O43493	480 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	COX7A2P2	O60397	106 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	OR7C2	O60412	319 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CNIH1	O95406	144 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CD24	P25063	80 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	BRS3	P32247	399 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	MYCNOS	P40205	109 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	NDP	Q00604	133 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	HES1	Q14469	280 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ADIRF	Q15847	76 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	IMMP2L	Q96T52	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	DERL1	Q9BUN8	251 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	BIN3	Q9NQY0	253 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF638-223	ENST00000492262	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms