RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF183	Q96D59	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TACC2	O95359	2948 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0B4J2A0	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FCN1	O00602	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL5	P05113	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ORM2	P19652	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	YIF1A	O95070	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFB8	O95169	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GZMB	P10144	247 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRI	P30626	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	DHRS2	Q13268	280 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	BATF	Q16520	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		G3V318	75 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	APELA	P0DMC3	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFA4	P12838	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYOD1	P15172	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	PROK1	P58294	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDP	Q00604	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms