RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
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NISCH-202ENST00000420808 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 ZFP30Q9Y2G7 519 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 SH2D1AO60880 128 aa12.11□□□□□ -0.47
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NISCH-202ENST00000420808 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa12.08□□□□□ -0.48
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NISCH-202ENST00000420808 TMEM189A5PLL7 270 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 GAS8-AS1O95177 125 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 RIGQ13278 110 aa12.07□□□□□ -0.48
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NISCH-202ENST00000420808 CCDC140Q96MF4 163 aa12.07□□□□□ -0.48
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NISCH-202ENST00000420808 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZQT7 251 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 A0A096LNJ9 63 aa12.06□□□□□ -0.48
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NISCH-202ENST00000420808 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 FAM162BQ5T6X4 162 aa12.05□□□□□ -0.48
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NISCH-202ENST00000420808 UBE2E1P51965 193 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 GNLYP22749 145 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 PSG9Q00887 426 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 OOSP1A8MZH6 123 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 EFNA4P52798 201 aa12.03□□□□□ -0.48
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