RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LTC4SQ16873 150 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC58Q4VC31 144 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q6Q795 121 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TCF24Q7RTU0 167 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SAXO1Q8IYX7 474 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF175Q8N4F7 328 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF561Q8N587 486 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR4K13Q8NH42 304 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LZICQ8WZA0 190 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DOHHQ9BU89 302 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RASL12Q9NYN1 266 aa2.33□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C17orf51A8MQB3 221 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LEUTXA8MZ59 168 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C16orf90A8MZG2 172 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC17A3O00476 420 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PFDN1O60925 122 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPY1RP25929 384 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRYBB3P26998 211 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SSR2P43308 183 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAS2R45P59539 299 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDC42P60953 191 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HBA1P69905 142 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NNATQ16517 81 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DAND5Q8N907 189 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR9A2Q8NGT5 310 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF675Q8TD23 568 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MALSU1Q96EH3 234 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC115Q96NT0 180 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCL19Q99731 98 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PBOV1Q9GZY1 135 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ASB4Q9Y574 426 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC13O75165 2243 aa2.32□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL7A1Q02388 2944 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A087WX48 190 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A6NED7 52 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DPRXA6NFQ7 191 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RIIAD1A6NNX1 92 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 H3BMM0 161 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TP53I11O14683 189 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GAS8-AS1O95177 125 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRYGSP22914 178 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MPV17P39210 176 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AKR1C3P42330 323 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EMP1P54849 157 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THEM6Q8WUY1 208 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACOT12Q8WYK0 555 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBE2WQ96B02 151 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TOMM6Q96B49 74 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPIN2AQ99865 258 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HSPB9Q9BQS6 159 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC32Q9BV29 185 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFCAB1Q9HAE3 211 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MED11Q9P086 117 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR5V1Q9UGF6 321 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.31□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAV41A0A0B4J266 112 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 I3L521 148 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFNA7P01567 189 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPL7P18124 248 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPX2P18283 190 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP6V0CP27449 155 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SERPINB10P48595 397 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB13P51153 203 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXA1P55317 472 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIGPP57054 158 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMIM21Q3B7S5 101 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms