RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 AP3S2P59780 193 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MYL5Q02045 173 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ESPL1Q14674 2120 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C1orf134Q5TEV5 83 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PDZD9Q8IXQ8 264 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DDI1Q8WTU0 396 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LINC00208Q96KT6 92 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM126AQ9H061 195 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 AKAP9Q99996 3911 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RTL1A6NKG5 1358 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LAMC1P11047 1609 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ITPR2Q14571 2701 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRAV27A0A087WT01 109 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC16A4O15374 487 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SULT1C4O75897 302 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MED21Q13503 144 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF56Q15929 161 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LYRM7Q5U5X0 104 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 Q5XG85 94 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARPINQ7Z6K5 226 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM9CQ8IZT9 166 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MALSU1Q96EH3 234 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C2orf50Q96LR7 162 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ROBO3Q96MS0 1386 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NCOA1Q15788 1441 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HTTP42858 3142 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PIAS1O75925 651 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DEFA3P59666 94 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SKP1P63208 163 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FXYD3Q14802 87 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C22orf39Q6P5X5 142 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 S100A7AQ86SG5 101 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 UCK1Q9HA47 277 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 USF3Q68DE3 2245 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LAMB1P07942 1786 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 A0A1W2PRS3 328 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C9orf170A2RU37 121 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 A8MT66 165 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MCRIP1C9JLW8 97 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DCTN3O75935 186 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR10J4P0C629 311 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WFDC2Q14508 124 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CNPY4Q8N129 248 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM86BQ8N661 226 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PPTC7Q8NI37 304 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 Q96NJ1 140 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARL5AQ9Y689 179 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 H7BYZ3 331 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CALB1P05937 261 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NMBP08949 121 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MPC1LP0DKB6 136 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SRIP30626 198 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RAB5CP51148 216 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RANP62826 216 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms