RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635849.1

ARID1B-210, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 5,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1B-210ENST00000635849 Q86TA4 180 aa8.5□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.5□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 ATRXP46100 2492 aa8.5□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 Q6ZWC4 215 aa8.5□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.5□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 LINC00477Q96M19 166 aa8.5□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.5□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 FGF6P10767 208 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 TMEM126AQ9H061 195 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 METRNQ9UJH8 293 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 IGLL1P15814 213 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 C5orf63A6NC05 138 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 Q6ZRM9 215 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 H3BMG7 143 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 UBL5Q9BZL1 73 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 SPTBN2O15020 2390 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 KLRD1Q13241 179 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.49□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 SRRM5B3KS81 715 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 CD177Q8N6Q3 437 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 RS1O15537 224 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 K7ERJ3 54 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 IGLV3-19P01714 112 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 THBDP07204 575 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 LYL1P12980 280 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 PFN2P35080 140 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 AMTNQ6UX39 209 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 A0A1W2PPM0 123 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 B5MCH6 92 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 SAP30O75446 220 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 CYYR1Q96J86 154 aa8.48□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 PATJQ8NI35 1801 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 CT83Q5H943 113 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 H0YJW9 148 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 EFNA2O43921 213 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 PINLYPA6NC86 204 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 KNCNA6PVL3 124 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GAGE12JA6NER3 117 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GAGE7O76087 117 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GAGE12FP0CL80 117 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GAGE12GP0CL81 117 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GAGE12IP0CL82 117 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 GAGE4Q13068 117 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 SS18Q15532 418 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.47□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 COX8AP10176 69 aa8.46□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.46□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 FREM3P0C091 2139 aa8.46□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 PSME4Q14997 1843 aa8.46□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 MED12Q93074 2177 aa8.46□□□□□ -1.05
ARID1B-210ENST00000635849 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 UTF1Q5T230 341 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 DKK1O94907 266 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 CRYBA4P53673 196 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 CARD19Q96LW7 228 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 C8orf49Q96NF6 230 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.46□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 DTX1Q86Y01 620 aa8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.45□□□□□ -1.06
ARID1B-210ENST00000635849 Q6ZVH6 145 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms