RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-4.15□□□□□ -3.07
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SULT1A1P50225 295 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 FABP9Q0Z7S8 132 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM78BQ5VT40 261 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYS1Q8N2H4 156 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-4.15□□□□□ -3.07
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RNU6-871P-201ENST00000516122 BPIFA3Q9BQP9 254 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 EURLQ9NYK6 297 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO9AB2RTY4 2548 aa-4.16□□□□□ -3.07
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RNU6-871P-201ENST00000516122 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa-4.16□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 BATF3Q9NR55 127 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANK1P16157 1881 aa-4.16□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4C46A6NHA9 309 aa-4.17□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PHBP35232 272 aa-4.17□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 NEDD8Q15843 81 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO48Q5FWF7 155 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM12Q96EX1 92 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 HYLS1Q96M11 299 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHRAC1Q9NRG0 131 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL5AQ9Y689 179 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP290O15078 2479 aa-4.17□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4K15Q8NH41 348 aa-4.18□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM126AQ9H061 195 aa-4.18□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CERS2Q96G23 380 aa-4.19□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM141Q96I45 108 aa-4.19□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 LIMS4P0CW20 117 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMB6P28072 239 aa-4.2□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 H0Y8G0 127 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFNA10P01566 189 aa-4.21□□□□□ -3.08
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RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10J4P0C629 311 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACYP2P14621 99 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDTP30046 118 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 SULT1E1P49888 294 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB5CP51148 216 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYCP1Q15431 976 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP18Q8N392 663 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOMM6Q96B49 74 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBP7Q96R05 134 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 WNK3Q9BYP7 1800 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEURL4Q96JN8 1562 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGT2B7P16662 529 aa-4.22□□□□□ -3.08
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