RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 C8orf49Q96NF6 230 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TXN2Q99757 166 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 GNB4Q9HAV0 340 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1W2PPQ1 181 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 BUB3O43684 328 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 GNG4P50150 75 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 Q86TA4 180 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 C20orf173Q96LM9 149 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 OR5B12Q96R08 314 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 H7BYZ3 331 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TRGC1P0CF51 173 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC35B1P78383 322 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ANAPC16Q96DE5 110 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 DIRC3C9JPN6 131 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 CD99P14209 185 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 RAB9AP51151 201 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TCL1AP56279 114 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ATP5G2Q06055 141 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT11Q96G61 164 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ATG101Q9BSB4 218 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 OTORQ9NRC9 128 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 MLXQ9UH92 298 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM223BA6NKX1 122 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SPINK4O60575 86 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 BRI3O95415 125 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00310P59036 64 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 Q8TAT8 98 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 GTSF1Q8WW33 167 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM68Q96MH6 324 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 IMMP2LQ96T52 175 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 VGLL1Q99990 258 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 IL36BQ9NZH7 164 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 THYN1Q9P016 225 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 RABAC1Q9UI14 185 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 F2Z2F3 143 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TYMSP04818 313 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 GZMBP10144 247 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 PF4V1P10720 104 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ARL3P36405 182 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ERCC8Q13216 396 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 PRR27Q6MZM9 219 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 GLMPQ8WWB7 406 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 UBE2CO00762 179 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SOCS3O14543 225 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 NUPR1O60356 82 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 CBLN1P23435 193 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TAS2R60P59551 318 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ERVFC1-1P60608 527 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 FOXL1Q12952 345 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 TM4SF20Q53R12 229 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 BAGE2Q86Y30 109 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-212ENST00000497037 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms