RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM223BA6NKX1 122 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MZ25 164 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf1O96002 111 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TOR2AQ5JU69 321 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM223AQ8IWN6 122 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2J3O76001 311 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R45P59539 299 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM37Q8WXS4 190 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TREM1Q9NP99 234 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 F8W735 103 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TOMM40O96008 361 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RD3LP0DJH9 198 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOGP84095 191 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf91Q5T1B1 145 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM78BQ5VT40 261 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF502Q8TBZ5 544 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 USMG5Q96IX5 58 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MANBALQ9NQG1 85 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 GNG7O60262 68 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PQLC2Q6ZP29 291 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC17Q9BRA2 123 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 COX7A2P2O60397 106 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 HYPMO75409 117 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf88P0DMB2 117 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL2P10415 239 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PSG1P11464 419 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf32Q32M92 178 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf113Q5VZT2 155 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PATE2Q6UY27 113 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 S100A7AQ86SG5 101 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SUN5Q8TC36 379 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC11CQ9BY50 192 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35B3Q9H1N7 401 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 VAX2Q9UIW0 290 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2C1O95371 312 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV1-51P01701 117 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5G2Q06055 141 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TIGITQ495A1 244 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 STXBP6Q8NFX7 210 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51G1Q8NGK1 321 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8WTZ3 238 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00052Q96N35 136 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 GNG13Q9P2W3 67 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GV50 99 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-11P01762 117 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSGP08311 255 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ICAM4Q14773 271 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 Q56UQ5 140 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM209BQ5JX69 171 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 RARRES2Q99969 163 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM167BQ9NRX6 74 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 C9JQL5 133 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 HAGHQ16775 308 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MIR17HGQ75NE6 70 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JLM5 398 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL14EPLP0DKL9 152 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 GCHFRP30047 84 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM231Q9H6L2 316 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF24Q9Y225 148 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SRP19P09132 144 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SFTA3P0C7M3 94 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 S100A7P31151 101 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FRAS1Q86XX4 4008 aa18.21■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TRGV3P03979 118 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC3BP05452 202 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ORM2P19652 201 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00305Q7Z4B0 112 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A10Q96PG2 267 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 F8W036 122 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM250H0YL14 139 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF600Q6ZNG1 722 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1B1Q8NGR6 318 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RXFP4Q8TDU9 374 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ADMP35318 185 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF125Q96EQ8 232 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC140Q96MF4 163 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA25Q9BR10 227 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms