RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531012.1

ARRB1-208, Transcript of arrestin beta 1, human

TSL 2

Gene ARRB1, Length 1,744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRB1-208	ENST00000531012	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	GCG	P01275	180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	CLEC3B	P05452	202 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	BRI3	O95415	125 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	FOXL1	Q12952	345 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	OR5I1	Q13606	314 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	CR1	P17927	2039 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARRB1-208	ENST00000531012	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012		H3BUA1	57 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	BMPR1B	O00238	502 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	ISLR	O14498	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	S100A7	P31151	101 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	BLCAP	P62952	87 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TRGC2	P03986	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TCRA	P04437	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TYMS	P04818	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	AP4M1	O00189	453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TRGV3	P03979	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	S100A6	P06703	90 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	IER3	P46695	156 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	UBE2G1	P62253	170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012		V9GYV3	84 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	APC	P25054	2843 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	SLC17A3	O00476	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	PDE6H	Q13956	83 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012		Q6ZS46	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	GNB4	Q9HAV0	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	C5orf52	A6NGY3	159 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	PHOX2A	O14813	284 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TPPP2	P59282	170 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	GPR82	Q96P67	336 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	POLQ	O75417	2590 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	CFHR3	Q02985	330 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	F8	P00451	2351 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	HIST1H2BK	O60814	126 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	LTA	P01374	205 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	HIST1H2BO	P23527	126 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ARRB1-208	ENST00000531012	HIST1H2BB	P33778	126 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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