RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 C7orf66A4D0T2 115 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 H3BMM0 161 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 UPK1BO75841 260 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF738Q8NE65 137 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 LYSTQ99698 3801 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 C11orf94C9JXX5 98 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 K7EPK0 472 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 SSNA1O43805 119 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 PRAF2O60831 178 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 DEDDO75618 318 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 CCNKO75909 580 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 CST7O76096 145 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 CAMLGP49069 296 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 EMP1P54849 157 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 PAX9P55771 341 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 FXYD7P58549 80 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 PSG9Q00887 426 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 BAXQ07812 192 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 FAM78BQ5VT40 261 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 ARV1Q9H2C2 271 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 BATF3Q9NR55 127 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC6-232ENST00000489053 RYR2Q92736 4967 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM189A5PLL7 270 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 H3BRN7 92 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 AGPAT2O15120 278 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 HBE1P02100 147 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 AMBPP02760 352 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 S100A11P31949 105 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 SULT1A1P50225 295 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 RHOBP62745 196 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 UHRF2Q96PU4 802 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 PFDN5Q99471 154 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 RFNGQ9Y644 331 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 A0A0J9YX75 114 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 IGLL5B9A064 214 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 F6UB75 175 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 INSP01308 110 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 PET100P0DJ07 73 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 FGF7P21781 194 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 HLA-DMBP28068 263 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 DEFB1P60022 68 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 ATP6V1FQ16864 119 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 LCN15Q6UWW0 184 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF709Q8N972 641 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 Q8NAQ8 132 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 HRH4Q9H3N8 390 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 A6NHS1 94 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 E5RGE8 158 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 SOCS3O14543 225 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 TCTAP57738 103 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 PLP1P60201 277 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 RAB32Q13637 225 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 RNF182Q8N6D2 247 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 MGST2Q99735 147 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HDAC6-232ENST00000489053 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.61□□□□□ -1.35
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