RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 TSPAN4O14817 238 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 EDN2P20800 178 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 GALR1P47211 349 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 MEOX2P50222 304 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM78BQ5VT40 261 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A22Q9H936 323 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 FUT9Q9Y231 359 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1W2PPV4 95 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAS2R45P59539 299 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 PAFAH1B2P68402 229 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TCF24Q7RTU0 167 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SORL1Q92673 2214 aa8.63□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR4C46A6NHA9 309 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB5CP51148 216 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB2AP61019 212 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 KHDC3LQ587J8 217 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 NOTCH1P46531 2555 aa8.62□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 LEMD1Q68G75 181 aa8.61□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMED6Q8WW62 240 aa8.61□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 NRN1Q9NPD7 142 aa8.61□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPRMQ9NS64 109 aa8.61□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 RFNGQ9Y644 331 aa8.61□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A087X0K7 114 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 GUCA2BQ16661 112 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 GUK1Q16774 197 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 MORN5Q5VZ52 161 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF785A8K8V0 405 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR7C2O60412 319 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 STAG3L2P0CL84 134 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 STAG3L3P0CL85 134 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 GP9P14770 177 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 PDE6HQ13956 83 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCN15Q6UWW0 184 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB24Q969Q5 203 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR51M1Q9H341 326 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 HRH4Q9H3N8 390 aa8.59□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 A6NJY4 79 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLC2P0DOY2 106 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 ID1P41134 155 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 SULT1A2P50226 295 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC01559Q495D7 138 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 DCANP1Q8TF63 244 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 PAXXQ9BUH6 204 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.58□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.57□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 K7EQG2 157 aa8.57□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 ISLRO14498 428 aa8.57□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF253O75346 499 aa8.57□□□□□ -1.04
ARHGEF3-211ENST00000486829 CXorf1O96002 111 aa8.57□□□□□ -1.04
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