RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 MEOX2P50222 304 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 H2BFSP57053 126 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 DEFB1P60022 68 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 HBG1P69891 147 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 HBG2P69892 147 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 NHLH2Q02577 135 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RAB31Q13636 194 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V1FQ16864 119 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 VWC2Q2TAL6 325 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 S100A7AQ86SG5 101 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 STX12Q86Y82 276 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.68□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 IGKV3-20P01619 116 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DRB4P13762 266 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 FGL1Q08830 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 MIC13Q5XKP0 118 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZRG5 221 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 C20orf173Q96LM9 149 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 F6UB75 175 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 COX7A2P2O60397 106 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PRR20EP86478 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PRR20CP86479 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PRR20DP86480 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PRR20BP86481 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PRR20AP86496 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 BAXQ07812 192 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RNF126Q9BV68 326 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RPRMQ9NS64 109 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 RNF24Q9Y225 148 aa6.66□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 A0A087X0K7 114 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 A0A0J9YX75 114 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 DEFB4AO15263 64 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 MPC2O95563 127 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 PTTG1O95997 202 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 FGF7P21781 194 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 FXYD7P58549 80 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 B2MP61769 119 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 OPCMLQ14982 345 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 MORN5Q5VZ52 161 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 XCL2Q9UBD3 114 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 ALG5Q9Y673 324 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 X6R8D5 127 aa6.65□□□□□ -1.34
SYN3-211ENST00000472027 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 CXorf65A6NEN9 183 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 MPDU1O75352 247 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 MIFP14174 115 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DMBP28068 263 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 PSG9Q00887 426 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 PMS2P11Q13670 270 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 FAM78BQ5VT40 261 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 RNF182Q8N6D2 247 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 Q8NAQ8 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 THAP6Q8TBB0 222 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.64□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SYN3-211ENST00000472027 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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