RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	MSR1	P38714	643 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	AIM18	P38884	321 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MND2	P40577	368 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	ALY2	P47029	1046 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MET13	P53128	600 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	PNP1	Q05788	311 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	SFH1	Q06168	426 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	YLL056C	Q12177	298 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	ARP7	Q12406	477 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	QCR6	P00127	147 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	PRC1	P00729	532 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	GPI10	P30777	616 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	CKB2	P38930	258 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SAE2	P46946	345 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YJR079W	P47126	109 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	PCL10	P53124	433 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	KTR6	P54070	446 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	PNG1	Q02890	363 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	PMT7	Q06644	662 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	HEM15	P16622	393 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MRPL25	P23369	157 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	PGS1	P25578	521 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	URB2	P47108	1174 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	RSM26	P47141	266 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	RTA1	P53047	317 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	BET4	Q00618	327 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YOR223W	Q12015	292 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MNL2	Q12205	849 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	GPM3	Q12326	303 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.25	□□□□□ -0.61	not detected
DDR2	YOL052C-A	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	IMA3	P0CW40	589 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	IMA4	P0CW41	589 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MAS1	P10507	462 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	POL3	P15436	1097 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MSH1	P25846	959 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YBR056W	P38081	501 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SIF2	P38262	535 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	BIT2	P38346	545 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SCC4	P40090	624 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	RRT5	P43607	289 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	VPS9	P54787	451 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	HEH2	Q03281	663 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	GRX8	Q05926	109 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	IMA2	Q08295	589 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	IDI1	P15496	288 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YIH1	P25637	258 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	PEX2	P32800	271 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	HSP78	P33416	811 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	OAF3	P36023	863 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	CDC27	P38042	758 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	LAM1	P38851	1228 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	STL1	P39932	569 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MRX6	P48564	524 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	USA1	Q03714	838 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	HIP1	P06775	603 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	KAR4	P25583	335 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YBR225W	P38321	900 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	RIM4	P38741	713 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YJL132W	P47014	750 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	IML2	P47031	731 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YPR003C	P53394	754 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SPO71	Q03868	1245 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	AAD15	Q08361	143 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	NRT1	Q08485	598 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SVS1	Q12254	260 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	VPS13	Q07878	3144 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YKR051W	P36142	418 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	FMP10	P40098	244 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	YGR127W	P53275	312 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SAM3	Q08986	587 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	DAL1	P32375	460 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	FUI1	P38196	639 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	RTT101	P47050	842 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	NMA111	P53920	997 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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