RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W SEC12P11655 471 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data5.25□□□□□ -1.57not detected
YKR047WYKR047W FEN2P25621 512 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W MUD2P36084 527 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W SET3P36124 751 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W EHT1P38295 451 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W FMO1P38866 432 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W NUP60P39705 539 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W AMA1P50082 593 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W MUP1P50276 574 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W YFT2Q06676 274 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ENB1Q08299 606 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TRM8Q12009 286 aa5.25□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W BET2P20133 325 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W SAN1P22470 610 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W MVD1P32377 396 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W BCS1P32839 456 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TMN3P40071 706 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W VFA1P40080 203 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W PIG2P40187 538 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W HOS4P40480 1083 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W DPH1P40487 425 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W BAP3P41815 604 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W IMA1P53051 589 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CBK1P53894 756 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TIM50Q02776 476 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W FDC1Q03034 503 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TRS31Q03337 283 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TMA10Q06177 86 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TFC6Q06339 672 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W MET3P08536 511 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ARP2P32381 391 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W LST4P34239 828 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TEF4P36008 412 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W AIM3P38266 947 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W FSH1P38777 243 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W YEL068CP39977 110 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W YER010CP40011 234 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ESL1P40456 1118 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W POL31P46957 487 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W RFX1P48743 811 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ATG21Q02887 496 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W VPS64Q03944 604 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W DLT1Q04216 342 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W LAS17Q12446 633 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W SOD2P00447 233 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CTT1P06115 562 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CDC31P06704 161 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CAF20P12962 161 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W DCG1P32460 244 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W PAH1P32567 862 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CNS1P33313 385 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W YBR053CP38235 358 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W STB5P38699 743 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W VPS8P39702 1274 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W NOP16P40007 231 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W SRB7P47822 140 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TPK1P06244 397 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W AAC3P18238 307 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PRP28P23394 588 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W YCR015CP25616 317 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W YJL193WP39542 402 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W ELO3P40319 345 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W BST1P43571 1029 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W INP52P50942 1183 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W RIM8P53179 542 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W ADY4Q05955 493 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W ICL2Q12031 575 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W COX17Q12287 69 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W FUM1P08417 488 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W VPS33P20795 691 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W TSA1P34760 196 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W YEL025CP39991 1188 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W LRO1P40345 661 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PSP1P50896 841 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W TEL2P53038 688 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W SNO4Q04902 237 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W HSP32Q08992 237 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W ZRT2Q12436 422 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W BIK1P11709 440 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W NTH1P32356 751 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W HIS7P33734 552 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W TOD6P34219 525 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W BCD1P38772 366 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W UPF3P48412 387 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W UBC11P52492 156 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W HOF1Q05080 669 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PCD1Q12524 340 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W FOB1O13329 566 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W CDC16P09798 840 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.7 ms