RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W CLB2P24869 491 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W LCB1P25045 558 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PAT1P25644 796 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CAF4P36130 643 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SEA4P38164 1038 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YBR287WP38355 427 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TDA3P38758 523 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W BCD1P38772 366 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SER3P40054 469 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W AVT6P40074 448 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W AXL1P40851 1208 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ISU1Q03020 165 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GCN5Q03330 439 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YFT2Q06676 274 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GAS4Q08271 471 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W POL1P13382 1468 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CTT1P06115 562 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W FBP26P32604 452 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MRP4P32902 394 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W KTR2P33550 425 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YBR138CP38277 524 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W BMT2P38278 337 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CCC2P38995 1004 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NOP9P47077 666 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W STR2P47164 639 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W IRC4Q03036 179 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W JIP4Q03361 876 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SPO77Q06134 477 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PPM2Q08282 695 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W BI4P03879 638 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MST1P07236 462 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ADY2P25613 283 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DBF20P32328 564 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YAP3P38749 330 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YIL166CP40445 542 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W UTP25P40498 721 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W LSM1P47017 172 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W UTP8P53276 713 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MPS1P54199 764 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SPC19Q03954 165 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RTT103Q05543 409 aa5.28□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W STF1P01098 86 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FBP1P09201 348 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YGL041W-AP0C5N3 154 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MATALPHA2P0CY08 210 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HMLALPHA2P0CY09 210 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CWH43P25618 953 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MGM101P32787 269 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MRS6P32864 603 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PAN5P38787 379 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ELP2P42935 788 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W QRI1P43123 477 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CSN12P47130 423 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W APT1P49435 187 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RSC58Q07979 502 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CET1O13297 549 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W POL30P15873 258 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TEC1P18412 486 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YPK2P18961 677 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RET1P22276 1149 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PRP28P23394 588 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YKR015CP36111 568 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PCH2P38126 564 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RCK2P38623 610 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W LNP1P38878 278 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MIC19P43594 170 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W UPF3P48412 387 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ACS1Q01574 713 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SIL1Q08199 421 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MPD2Q99316 277 aa5.27□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HXK1P04806 485 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PHO8P11491 566 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W DBP5P20449 482 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W DMC1P25453 334 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W DPH2P32461 534 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HIR1P32479 840 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ORC2P32833 620 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CYM1P32898 989 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NUP133P36161 1157 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W AAP1P37898 856 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MTG2P38860 518 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TAT2P38967 592 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FRT2P39734 528 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YER184CP39961 794 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NUP82P40368 713 aa5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 95.7 ms