RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 HPSEQ9Y251 543 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ADAM21Q9UKJ8 722 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 LMAN1P49257 510 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 SLC39A14Q15043 492 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 PDILTQ8N807 584 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 TC2NQ8N9U0 490 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 CLIC6Q96NY7 704 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 MYO1CO00159 1063 aa23.57■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 FOXN1O15353 648 aa23.57■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 GPS2Q13227 327 aa23.57■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.57■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 RABGGTAQ92696 567 aa23.57■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 OSBP2Q969R2 916 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 PRC1O43663 620 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 ANTXR2P58335 489 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 MTF1Q14872 753 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 SLAIN2Q9P270 581 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 A0A0U1RQJ8 604 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 FBXL16Q8N461 479 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 ATG3Q9NT62 314 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 C4AP0C0L4 1744 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 C4BP0C0L5 1744 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA1Q92805 767 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 PTPAQ15257 358 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 LONRF3Q496Y0 759 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 ZNF790Q6PG37 636 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 A0A087WZG4 1122 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 BRINP3Q76B58 766 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 EXOC4Q96A65 974 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 MAP2K7O14733 419 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 CPLX1O14810 134 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 TXLNAP40222 546 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 VPS37DQ86XT2 251 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 STX10O60499 249 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 CASP7P55210 303 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-222ENST00000639501 OLFM4Q6UX06 510 aa23.52■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 AK7Q96M32 723 aa23.52■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.52■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.52■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 CCDC151A5D8V7 595 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 RESP18Q5W5W9 173 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 SPECC1Q5M775 1068 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 SRLQ86TD4 932 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K14Q99558 947 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 RXRAP19793 462 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ZNF827Q17R98 1081 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PNKPQ96T60 521 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 MCM6Q14566 821 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 VPS18Q9P253 973 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PPP6R2O75170 966 aa23.49■■□□□ 1.35
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