RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629380.2

SYNGAP1-208, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SYNGAP1, Length 9,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1-208ENST00000629380 PPFIA1Q13136 1202 aa14.77□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TCHPQ9BT92 498 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 AFMP43652 599 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 EYA3Q99504 573 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TRIM75PA6NK02 468 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 HS1BP3Q53T59 392 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 PCK1P35558 622 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 NOX5Q96PH1 765 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SH2D4AQ9H788 454 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SSFA2P28290 1259 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 PLCB4Q15147 1175 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 DPH6Q7L8W6 267 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 PTGS1P23219 599 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TTC22Q5TAA0 569 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RASA3Q14644 834 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 NLRP3Q96P20 1036 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 VPS18Q9P253 973 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 PRR16Q569H4 304 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 IFT81Q8WYA0 676 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 DNAI1Q9UI46 699 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ATL3Q6DD88 541 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 FLT4P35916 1363 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CEP170Q5SW79 1584 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ALG1Q9BT22 464 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ARHGAP25P42331 645 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ZFYVE9O95405 1425 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 KIF11P52732 1056 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CERS3Q8IU89 383 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 IL16Q14005 1332 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RASSF2P50749 326 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 LGSNQ5TDP6 509 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 FLIIQ13045 1269 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 KRT79Q5XKE5 535 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SMIM23A6NLE4 172 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 KRT5P13647 590 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 IFT20Q8IY31 132 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TBX22Q9Y458 520 aa14.73□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 A0A1B0GUL7 405 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CHRNA2Q15822 529 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RFX1P22670 979 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RAD50Q92878 1312 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 MTMR3Q13615 1198 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 SPOPO43791 374 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 BIRC2Q13490 618 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 KAT6AQ92794 2004 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ELP1O95163 1332 aa14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 PANK2Q9BZ23 570 aa14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 CCDC38Q502W7 563 aa14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 ZNF365Q70YC5 407 aa14.71□□□□□ -0.05
SYNGAP1-208ENST00000629380 HAND2P61296 217 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNGAP1-208ENST00000629380 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNGAP1-208ENST00000629380 Q9H521 79 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNGAP1-208ENST00000629380 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 183.8 ms