RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	DES	P17661	470 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	PLCG2	P16885	1265 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	CETN1	Q12798	172 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	GOLGA1	Q92805	767 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	CETN2	P41208	172 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AKAP9-216	ENST00000619023	MYO1B	O43795	1136 aa		12.9	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CUTA	O60888	179 aa		12.9	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	12.9	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	FEZ1	Q99689	392 aa		12.9	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		12.9	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		12.9	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PLIN2	Q99541	437 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	HAUS7	Q99871	368 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ADCY9	O60503	1353 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	AKR1B10	O60218	316 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	SAMM50	Q9Y512	469 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	IQUB	Q8NA54	791 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD62	A6NC57	917 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT83	P78385	493 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	MYL10	Q9BUA6	226 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CTSW	P56202	376 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35	2e-6	■■■□□ 16.3
AKAP9-216	ENST00000619023	SPECC1	Q5M775	1068 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PHKB	Q93100	1093 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	GNA11	P29992	359 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	USP8	P40818	1118 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TBC1D5	Q92609	795 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	GNPAT	O15228	680 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	HSF2BP	O75031	334 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF202	O95125	648 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PROSER3	Q2NL68	480 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	RIMBP2	O15034	1052 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	LMAN1	P49257	510 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TCIRG1	Q13488	830 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT79	Q5XKE5	535 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	DRC1	Q96MC2	740 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TNNI2	P48788	182 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	FANCC	Q00597	558 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	MYZAP	P0CAP1	466 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT40	Q6A162	431 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TOM1	O60784	492 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	PFKFB2	O60825	505 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TACC1	O75410	805 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC172	P0C7W6	258 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-216	ENST00000619023	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35

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