RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC14	Q49A88	953 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	KDR	P35968	1356 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PTPRT	O14522	1441 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	GAS8	O95995	478 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	MCM7	P33993	719 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SPATA5	Q8NB90	893 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA1	Q92805	767 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	KIFAP3	Q92845	792 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	AFM	P43652	599 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SULF1	Q8IWU6	871 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF165	P49910	485 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TMC6	Q7Z403	805 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	BCS1L	Q9Y276	419 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CEP152	O94986	1710 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SPTLC2	O15270	562 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	IQUB	Q8NA54	791 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	BIN1	O00499	593 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	AKR1B10	O60218	316 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TAF3	Q5VWG9	929 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	FAM212A	Q96EL1	285 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	FNBP1	Q96RU3	617 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ATP2A1	O14983	1001 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PHKG2	P15735	406 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TNNT1	P13805	278 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	JAG2	Q9Y219	1238 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	UBASH3A	P57075	661 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	NEK11	Q8NG66	645 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PANK2	Q9BZ23	570 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	7.46	□□□□□ -1.21	2e-9	■■■■■ 48.2
ACACA-240	ENST00000617649	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SHTN1	A0MZ66	631 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CHL1	O00533	1208 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	7.46	□□□□□ -1.21	1e-6	■■□□□ 14.1
ACACA-240	ENST00000617649	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	JADE2	Q9NQC1	790 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ABCC3	O15438	1527 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ADCY7	P51828	1080 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	PPM1E	Q8WY54	764 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	KRT83	P78385	493 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	GPAA1	O43292	621 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	LTK	P29376	864 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	STX10	O60499	249 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	A1BG	P04217	495 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NECAB1	Q8N987	351 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	DHX58	Q96C10	678 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ARMT1	Q9H993	441 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	F13A1	P00488	732 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TUBB4B	P68371	445 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SNX21	Q969T3	373 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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