RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 VEZTQ9HBM0 779 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 SPEF2Q9C093 1822 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2A2P52657 109 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 RASA3Q14644 834 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF22Q14807 665 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL15Q16663 113 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP100Q494V2 611 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 SHISA4Q96DD7 197 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 CD209Q9NNX6 404 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 PRMT2P55345 433 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 HTATIP2Q9BUP3 242 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 NR2E3Q9Y5X4 410 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PPC1 479 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 SMC5Q8IY18 1101 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 SIL1Q9H173 461 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR2O60603 784 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHDP01880 384 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 OTOFQ9HC10 1997 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 MTFR1Q15390 333 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMA3Q16787 3333 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 F8W031 263 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNJ4P48050 445 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC24Q50LG9 513 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 AOX1Q06278 1338 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFAIP1Q13829 316 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 GJA8P48165 433 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL24Q5JXM2 366 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K9P80192 1104 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 CHRNDQ07001 517 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 VGLL4Q14135 290 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR108Q9NPR9 543 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 GJB1P08034 283 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 TEPSINQ96N21 525 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 CSADQ9Y600 493 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE8BO95263 885 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 CETPP11597 493 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 IL1R1P14778 569 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1B0GUL6 1792 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.228e-20■■□□□ 14.3
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 SRRDQ9UH36 339 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 TFCP2Q12800 502 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 BTBD19C9JJ37 291 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL5P13501 91 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXD10P28358 340 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 GRK4P32298 578 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE4AQ14139 1066 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-214ENST00000592483 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 RAET1EQ8TD07 263 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF208Q9H0X6 261 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 SNAP23O00161 211 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 NUCB1Q02818 461 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.87■■■□□ 2.21
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