RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591265.1

ZNF554-204, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ZNF554, Length 1,148 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-204ENST00000591265 DCAF15Q66K64 600 aa22.15■■□□□ 1.14
ZNF554-204ENST00000591265 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ZNF554-204ENST00000591265 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.15■■□□□ 1.14
ZNF554-204ENST00000591265 WRNIP1Q96S55 665 aa22.15■■□□□ 1.14
ZNF554-204ENST00000591265 BCAR3O75815 825 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 PRMT2P55345 433 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 PPIL2Q13356 520 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 BTBD19C9JJ37 291 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 IRF6O14896 467 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 BCAMP50895 628 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 CACNB3P54284 484 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 PPATQ06203 517 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 FGFR2P21802 821 aa22.11■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.11■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.11■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.1■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 TRIM27P14373 513 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 C17orf99Q6UX52 265 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 FAM151AQ8WW52 585 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 LPIN2Q92539 896 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 USP44Q9H0E7 712 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF554-204ENST00000591265 SLC5A1P13866 664 aa22.07■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.07■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.07■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.07■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.07■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 EYA2O00167 538 aa22.06■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 MS4A1P11836 297 aa22.06■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 HOXD10P28358 340 aa22.06■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 INPP5BP32019 993 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 SRRDQ9UH36 339 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 PDHXO00330 501 aa22.04■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 FBXO3Q9UK99 471 aa22.04■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 GNAI3P08754 354 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 PSMC4P43686 418 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 CPA4Q9UI42 421 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 TRIM47Q96LD4 638 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF554-204ENST00000591265 CXCL11O14625 94 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 ZBTB22O15209 634 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 TCP10Q12799 353 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 MOGSQ13724 837 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 H0YGN5 161 aa22■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 CIAO1O76071 339 aa22■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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ZNF554-204ENST00000591265 OSBPP22059 807 aa22■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 CTGFP29279 349 aa22■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 RAET1EQ8TD07 263 aa22■■□□□ 1.11
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ZNF554-204ENST00000591265 SEMA3EO15041 775 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 GRK4P32298 578 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 NFIAQ12857 509 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 USP40Q9NVE5 1235 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 PRDX5P30044 214 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 MTFR1Q15390 333 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 MYPNQ86TC9 1320 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 GJB1P08034 283 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 BCRP11274 1271 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 GJA8P48165 433 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 ATP2B3Q16720 1220 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ZNF554-204ENST00000591265 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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