RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PAGE1O75459 146 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS20O76081 388 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PSAPP07602 524 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CD33P20138 364 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GIPRP48546 466 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 NRLP54845 237 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 HYAL2Q12891 473 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 DDR2Q16832 855 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM182BQ5T319 152 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RASIP1Q5U651 963 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 APPBP2Q92624 585 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC3Q9BY71 257 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF576Q9H609 170 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPKBP1O60336 1514 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CHD1O14646 1710 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP160Q12769 1436 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A096LPE4 126 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PPZ6 126 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 F13A1P00488 732 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GYS2P54840 703 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 AMPD3Q01432 767 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 KANK3Q6NY19 840 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 BHMTQ93088 406 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PLD4Q96BZ4 506 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 AAASQ9NRG9 546 aa5.69□□□□□ -1.5
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CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 H7C1W4 665 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 J3QW42 95 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ST8SIA5O15466 376 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PDPK1O15530 556 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MAN1A2O60476 641 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 BMP6P22004 513 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MCM4P33991 863 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 SIK1P57059 783 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GPLD1P80108 840 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 SQSTM1Q13501 440 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RASGRF1Q13972 1273 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ARSHQ5FYA8 562 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 HOMER1Q86YM7 354 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MUC3BQ9H195 1237 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RASSF4Q9H2L5 321 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM260Q9NX78 707 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 HFM1A2PYH4 1435 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MIA2Q96PC5 1412 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM221AA4D161 298 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP11AP98196 1134 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CTBSQ01459 385 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PNMA5Q96PV4 448 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CRBNQ96SW2 442 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MDFIQ99750 246 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PBX4Q9BYU1 374 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TMX1Q9H3N1 280 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PPME1Q9Y570 386 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 AKNAQ7Z591 1439 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 C2CD2LO14523 706 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FGFR3P22607 806 aa5.66□□□□□ -1.5
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